A Rejtély Rt. csapata újabb kalandja során Japánba utazik, hogy egy bosszúálló szellem titkára derítsen fényt. Bozont és Scooby nem akármilyen küzdősport- és kardleckéket vesz, miközben a többiekkel együtt a Fekete Szamuráj, a nagy nindzsa harcos szellemével kell megküzdeniük.