Az Éjszaka a múzeumban: Kahmunrah visszatér egy vadonatúj animációs kaland, a nagy sikerű filmsorozat alapján. Nick Daley nyári éjjeliőr melója a Természetrajzi Múzeumban minden középiskolás számára hatalmas kihívást jelentene. Szerencsére apja nyomdokaiba lép, és ismeri a múzeum ősi tábláját, amely varázserejével napnyugtakor mindent életre kelt. Nick örül, hogy újra láthatja régi barátait, köztük Teddyt, Sacagaweát és Rexi. Azonban amikor a bosszúszomjas uralkodó, Kahmunrah, kiszabadul, hogy kinyissa az egyiptomi alvilág kapuját, és felszabadítsa a holtak hadseregét, Nicken múlik, hogy megállítsa a tébolyult uralkodót, és egyszer s mindenkorra megmentse a múzeumot.